Вравнивание предполагаемых ортологов белка ALKH_ECOLI
*
ALKH_ECOLI : AGAQFAISPGLT : 12
ALKH_TREPA : AGAQFVVSPGFN : 12
ALKD_PSEPU : AGAQFVVTPGIT : 12
ALKH_ZYMMO : AGCEFFVSPGLT : 12
FLGI_VIBCH : VPNPFGRGDYIT : 12
PURA_SYNEL : RGAEFGTTTGRR : 12
g F g
Поиск выбранных предполагаемых ортологов по различным паттернам
| Характеристика паттерна | Паттерн | В скольких последовательностях банка Swiss-Prot найден мотив, удовлетворяющий паттерну? | Все ли последовательности из выравнивания найдены? |
| Фрагмент последовательности | AGAQFAISPGLT | 5 | Найдены 2 последовательности из 6-ти |
| Сильный | [VRA]-[PG]-[NAC]-[PEQ]-F-[GVAF]-[RTVI]-[GTS]-[DTP]-[YG]-[IRFL]-[TRN] | 12 | Все последовательности найдены |
| Слабый | [VRA]-[PG]-[NAC]-[PEQ]-F-X(2)-{PR}-X-[YG]-{WH}-[TRN] | 54 | Все последовательности найдены |